上海商铺交易税费按买方和卖方区分需要缴纳不同的税费，具体如下：
买家所应该支付的税费如下：
1、房地产交易手续费：商铺交易手续费为11元/平方米*建筑面积。
2、上海商铺买卖房屋登记费：550元/本。
3、权证印花税：5元/本。
4、印花税：从2009年至今暂免征收。
5、契税：商铺应该交纳成交价或是评估价的3%的契税。
卖家支付税费如下：
1、税费：3元/平方米*建筑面积。
2、印花税：从2009年至今暂免征收。
3、土地税：可提供上海购房票据的，土地税＝［转让收入-购房票据价格（每年加计5％）-有关税金］×适用税率。不能提供购房票据的，土地税＝（转让收入-转让收入×90％）×30％。
4、个人所得税：如果所售房产是非住宅类房产则不管什么情况都要缴纳个人所得税。而且地税局在征税过程中对于营业税缴纳差额的情况，个人所得税也必须征收差额的20% 。
5、营业税及附加税：税率5.6%， 卖方缴纳（如果所售房产是非住宅类如商铺、写字间或厂房等则不论证是否过5年都需要全额征收营业税。）
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